Αν και δεν έχουν ανακοινωθεί επισήμως οι λόγοι της παρουσίας του συγκεκριμένου αεροσκάφους στην Κύπρο, η χρήση C-40C συνήθως υποδηλώνει μετακινήσεις κυβερνητικών ή στρατιωτικών στελεχών υψηλού επιπέδου, στο πλαίσιο συντονισμού ενεργειών ή διμερών επαφών.